免费版论文查重工具通常支持常见的文本文件格式，如doc、docx、pdf等，以及常用的压缩文件格式，如zip、rar等。用户可将论文以这些格式上传至查重工具进行检测，确保文本内容的原创性和学术诚信。

此外，免费版论文查重工具还可能支持一些其他常见的文档格式，如txt、ppt等，具体支持的文件格式可根据不同的查重工具而有所差异。在使用免费版论文查重工具时，建议用户注意查看工具的文件格式支持列表，以确保上传的文档能够被正确检测。